Macrófitas são grupos de plantas aquáticas que tendem a proliferar em ambientes como os reservatórios. Elas possuem um importante papel ecológico na ciclagem de nutrientes dos ambientes aquáticos mas sua proliferação em excesso precisa ser controlada. Dessa forma, a UHE Queimado realiza o monitoramento das macrófitas aquáticas no reservatório a cada três meses com vistas a impedir o crescimento acelerado desse grupo de organismos e manter a qualidade do ambiente.
Algumas espécies possuem crescimento e expansão dependentes das condições sazonais que interferem no volume de água do reservatório e na disponibilidade de nutrientes provenientes principalmente dos usos do solo existentes às margens do reservatório.
